Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NRG1Q02297 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NRG1Q02297 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms