Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLCB3Q01970 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms