Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA6Q01524 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA6Q01524 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms