Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MYBPC1Q00872 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MYBPC1Q00872 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms