Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDC42EP1Q00587 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP1Q00587 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms