Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDK17Q00537 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDK17Q00537 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDK17Q00537 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK17Q00537 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK17Q00537 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK17Q00537 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms