Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDK5Q00535 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms