Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GTF2BQ00403 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms