Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD1P98174 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD1P98174 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD1P98174 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD1P98174 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms