Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FAM3AP98173 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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