Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RHOBP62745 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms