Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VBP1P61758 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VBP1P61758 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VBP1P61758 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VBP1P61758 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms