Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK11-1P61568 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms