Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVPABLB-1P60509 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms