Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RIPK4P57078 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIPK4P57078 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms