Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAG2P55895 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAG2P55895 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAG2P55895 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAG2P55895 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAG2P55895 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAG2P55895 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAG2P55895 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAG2P55895 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAG2P55895 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms