Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PAX9P55771 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PAX9P55771 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PAX9P55771 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX9P55771 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PAX9P55771 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms