Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EFNA3P52797 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EFNA3P52797 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms