Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UBE2E1P51965 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms