Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT4P50991 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCT4P50991 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCT4P50991 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT4P50991 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT4P50991 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT4P50991 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT4P50991 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT4P50991 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT4P50991 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms