Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRE11P49959 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MRE11P49959 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRE11P49959 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms