Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUP153P49790 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
NUP153P49790 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NUP153P49790 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NUP153P49790 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NUP153P49790 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.53
NUP153P49790 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUP153P49790 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUP153P49790 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUP153P49790 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUP153P49790 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUP153P49790 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUP153P49790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms