Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTAP49354 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms