Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNNI2P48788 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms