Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCLMP48507 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCLMP48507 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLMP48507 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLMP48507 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLMP48507 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLMP48507 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCLMP48507 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCLMP48507 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCLMP48507 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms