Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD4P46934 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NEDD4P46934 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms