Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOP2P46087 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOP2P46087 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOP2P46087 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NOP2P46087 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NOP2P46087 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
NOP2P46087 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NOP2P46087 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOP2P46087 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOP2P46087 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NOP2P46087 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms