Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PIK3CBP42338 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PIK3CBP42338 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms