Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FDFT1P37268 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms