Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP62P37198 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP62P37198 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP62P37198 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP62P37198 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms