Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LTBRP36941 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LTBRP36941 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LTBRP36941 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms