Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5C1P36542 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms