Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDIT3P35638 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDIT3P35638 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms