Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG3P32926 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG3P32926 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms