Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
OTX2P32243 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTX2P32243 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTX2P32243 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
OTX2P32243 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms