Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXA11P31270 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXA11P31270 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms