Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECHS1P30084 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms