Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTPRMP28827 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTPRMP28827 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTPRMP28827 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
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