Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SSFA2P28290 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms