Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRKCHP24723 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRKCHP24723 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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