Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VAMP1P23763 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms