Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPRDP23468 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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