Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EPHA1P21709 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EPHA1P21709 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms