Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCNA2P20248 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms