Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGCP20142 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGCP20142 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGCP20142 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGCP20142 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PGCP20142 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGCP20142 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGCP20142 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGCP20142 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms