Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDSP20132 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDSP20132 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDSP20132 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDSP20132 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDSP20132 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDSP20132 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDSP20132 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDSP20132 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDSP20132 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms