Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2CP19387 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms