Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME1P15531 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME1P15531 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME1P15531 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NME1P15531 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NME1P15531 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME1P15531 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME1P15531 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME1P15531 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME1P15531 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME1P15531 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME1P15531 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME1P15531 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME1P15531 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms