Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXB1P14653 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms