Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A1P13866 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms